Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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LTAP01374 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LTAP01374 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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