Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms