Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms