Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms