Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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