Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Length 1,043 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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