Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP13Q92995 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP13Q92995 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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