Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms