Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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