Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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