Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms