Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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