Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRXP46100 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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