Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms