Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASA1P20936 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASA1P20936 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RASA1P20936 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASA1P20936 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms