Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCNA2P20248 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCNA2P20248 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCNA2P20248 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCNA2P20248 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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