Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms