Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms