Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms