Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SIX1Q15475 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SIX1Q15475 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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