Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms