Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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