Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms