Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRABP1P29762 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms