Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF2P15336 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms