Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMNAP02545 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMNAP02545 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMNAP02545 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMNAP02545 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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