Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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