Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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