Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms