Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCAMP43121 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCAMP43121 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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