Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms