Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms