Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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