Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms