Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms