Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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