Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms