Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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