Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms