Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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