Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC4Q5GLZ8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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