Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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