Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SRSF5Q13243 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SRSF5Q13243 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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SRSF5Q13243 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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