Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms