Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJB2P29033 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms