Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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