Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms