Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms