Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms