Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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